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Jason E. Stajich

La nomination

  • Boursier
  • Règne fongique : Menaces et possibilités

Institution

  • Université de la Californie à Riverside
Microbiologie et phytopathologie et Institut de biologie génomique intégrative

Pays

  • États Unis

Éducation

Ph.D. (génétique et génomique), Université Duke
B.S. (informatique), Université Duke

À propos

Le bioinformaticien Jason E. Stajich étudie l’évolution des organismes fongiques à l’aide de la génomique comparative et populationnelle.

Stajich et son groupe de recherche séquencent et analysent des génomes d’organismes fongiques pour résoudre des relations phylogénétiques et comprendre l’évolution des symbioses fongiques avec les plantes, les animaux et autres microorganismes. Ce travail requiert un large échantillonnage de génomes à travers le règne, en mettant l’accent sur l’étude des zygomycètes et des chytrides. Dans ses études en biologie populationnelle, il examine la variabilité génomique chez l’organisme fongique pathogène humain Aspergillus fumigatus et les espèces de Candida. Il met au point des méthodes bioinformatiques et comparatives pour mieux identifier les gènes qui pourraient être responsable de la médiation des interactions hôtes-microorganismes dans une variété d’organismes fongiques associés à des plantes et à des animaux. De plus, son laboratoire utilise les organismes fongiques filamenteux Neurospora et Rhizopus pour explorer la génétique des interactions bactéries-organismes fongiques.

Prix

Prix C. J. Alexopoulos, Mycological Society of America, 2014 Boursier Kavli, Kavli Frontiers of Science, 2015

Bourse de recherche, Institut Miller de recherche fondamentale, 2006-2009

Publications Pertinentes

Bewick AJ, Hofmeister BT, Powers RA, Mondo SJ, Grigoriev IV, James TY, Stajich JE, Schmitz RJ. Diversity of cytosine methylation across the fungal tree of life. Nat Ecol Evol. 2019 mar.;3(3):479-490

Demers EG, Biermann AR, Masonjones S, Crocker AW, Ashare A, Stajich JE, Hogan DA. Evolution of drug resistance in an antifungal-naive chronic Candida lusitaniae infection. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018; 115(47):12040-12045.

Nguyen TA, Cissé OH, Yun Wong J, Zheng P, Hewitt D, Nowrousian M, Stajich JE, Jedd G. Innovation and constraint leading to complex multicellularity in the Ascomycota. Nat Commun. 2017; 8:14444.

Spatafora JW, Chang Y, Benny GL, Lazarus K, Smith ME, Berbee ML, Bonito G, Corradi N, Grigoriev I, Gryganskyi A, James TY, O'Donnell K, Roberson RW, Taylor TN, Uehling J, Vilgalys R, White MM, Stajich JE. A phylum-level phylogenetic classification of zygomycete fungi based on genome-scale data. Mycologia 2016;108(5):1028-1046.

Rosenblum EB, James TY, Zamudio KR, Poorten TJ, Ilut D, Rodriguez D, Eastman JM, Richards-Hrdlicka K, Joneson S, Jenkinson TS, Longcore JE, Parra Olea G, Toledo LF, Arellano ML, Medina EM, Restrepo S, Flechas SV, Berger L, Briggs CJ, Stajich JE. Complex history of the amphibian-killing chytrid fungus revealed with genome resequencing data. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013; 110(23):9385-90.

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